Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MBD3O95983 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MBD3O95983 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MBD3O95983 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MBD3O95983 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MBD3O95983 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MBD3O95983 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MBD3O95983 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD3O95983 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD3O95983 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD3O95983 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD3O95983 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD3O95983 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD3O95983 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD3O95983 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD3O95983 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD3O95983 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD3O95983 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD3O95983 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD3O95983 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD3O95983 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD3O95983 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD3O95983 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD3O95983 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD3O95983 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD3O95983 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD3O95983 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD3O95983 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MBD3O95983 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MBD3O95983 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MBD3O95983 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MBD3O95983 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MBD3O95983 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MBD3O95983 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MBD3O95983 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MBD3O95983 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MBD3O95983 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MBD3O95983 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MBD3O95983 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MBD3O95983 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MBD3O95983 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MBD3O95983 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MBD3O95983 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MBD3O95983 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MBD3O95983 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MBD3O95983 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MBD3O95983 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MBD3O95983 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MBD3O95983 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MBD3O95983 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MBD3O95983 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MBD3O95983 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MBD3O95983 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MBD3O95983 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MBD3O95983 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MBD3O95983 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MBD3O95983 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MBD3O95983 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MBD3O95983 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MBD3O95983 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MBD3O95983 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MBD3O95983 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MBD3O95983 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MBD3O95983 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MBD3O95983 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MBD3O95983 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MBD3O95983 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD3O95983 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD3O95983 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD3O95983 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MBD3O95983 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MBD3O95983 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MBD3O95983 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD3O95983 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD3O95983 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD3O95983 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD3O95983 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD3O95983 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD3O95983 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD3O95983 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD3O95983 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD3O95983 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD3O95983 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD3O95983 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD3O95983 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD3O95983 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD3O95983 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD3O95983 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD3O95983 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD3O95983 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD3O95983 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD3O95983 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD3O95983 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD3O95983 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD3O95983 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MBD3O95983 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MBD3O95983 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MBD3O95983 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MBD3O95983 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MBD3O95983 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms