Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTLL1O95922 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTLL1O95922 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL1O95922 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL1O95922 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL1O95922 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTLL1O95922 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTLL1O95922 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTLL1O95922 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTLL1O95922 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL1O95922 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TTLL1O95922 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL1O95922 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms