Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAPINO95295 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAPINO95295 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAPINO95295 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAPINO95295 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPINO95295 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms