Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR47O94967 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR47O94967 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR47O94967 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR47O94967 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR47O94967 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR47O94967 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR47O94967 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR47O94967 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR47O94967 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR47O94967 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR47O94967 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR47O94967 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR47O94967 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR47O94967 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR47O94967 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR47O94967 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR47O94967 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR47O94967 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR47O94967 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR47O94967 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR47O94967 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR47O94967 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR47O94967 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR47O94967 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR47O94967 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR47O94967 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR47O94967 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR47O94967 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WDR47O94967 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR47O94967 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR47O94967 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR47O94967 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR47O94967 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WDR47O94967 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR47O94967 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR47O94967 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
WDR47O94967 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR47O94967 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WDR47O94967 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR47O94967 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR47O94967 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR47O94967 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR47O94967 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR47O94967 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR47O94967 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR47O94967 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR47O94967 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR47O94967 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR47O94967 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR47O94967 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR47O94967 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR47O94967 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR47O94967 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR47O94967 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR47O94967 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR47O94967 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR47O94967 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR47O94967 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR47O94967 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR47O94967 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR47O94967 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR47O94967 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR47O94967 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR47O94967 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR47O94967 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR47O94967 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR47O94967 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR47O94967 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR47O94967 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR47O94967 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR47O94967 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR47O94967 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR47O94967 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR47O94967 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR47O94967 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR47O94967 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR47O94967 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR47O94967 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR47O94967 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR47O94967 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR47O94967 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR47O94967 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR47O94967 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR47O94967 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR47O94967 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR47O94967 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR47O94967 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms