Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP1O94782 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP1O94782 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP1O94782 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP1O94782 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP1O94782 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP1O94782 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP1O94782 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP1O94782 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP1O94782 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP1O94782 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP1O94782 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP1O94782 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP1O94782 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP1O94782 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP1O94782 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP1O94782 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP1O94782 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP1O94782 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP1O94782 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP1O94782 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP1O94782 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP1O94782 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP1O94782 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP1O94782 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP1O94782 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP1O94782 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP1O94782 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP1O94782 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP1O94782 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP1O94782 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP1O94782 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP1O94782 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP1O94782 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP1O94782 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP1O94782 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP1O94782 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP1O94782 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP1O94782 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP1O94782 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP1O94782 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP1O94782 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP1O94782 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP1O94782 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP1O94782 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP1O94782 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP1O94782 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP1O94782 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP1O94782 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP1O94782 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP1O94782 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP1O94782 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP1O94782 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP1O94782 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP1O94782 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP1O94782 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP1O94782 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP1O94782 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP1O94782 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP1O94782 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP1O94782 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP1O94782 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP1O94782 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP1O94782 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP1O94782 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP1O94782 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP1O94782 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP1O94782 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP1O94782 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP1O94782 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP1O94782 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP1O94782 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP1O94782 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP1O94782 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP1O94782 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP1O94782 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP1O94782 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP1O94782 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP1O94782 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP1O94782 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP1O94782 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP1O94782 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP1O94782 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP1O94782 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP1O94782 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP1O94782 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP1O94782 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP1O94782 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP1O94782 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP1O94782 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP1O94782 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP1O94782 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP1O94782 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP1O94782 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP1O94782 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP1O94782 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP1O94782 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP1O94782 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP1O94782 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP1O94782 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms