Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
BBOX1O75936 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
BBOX1O75936 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
BBOX1O75936 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
BBOX1O75936 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
BBOX1O75936 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BBOX1O75936 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BBOX1O75936 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
BBOX1O75936 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BBOX1O75936 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
BBOX1O75936 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
BBOX1O75936 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BBOX1O75936 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
BBOX1O75936 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
BBOX1O75936 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
BBOX1O75936 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BBOX1O75936 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BBOX1O75936 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
BBOX1O75936 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BBOX1O75936 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms