Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC43A1O75387 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC43A1O75387 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC43A1O75387 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC43A1O75387 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC43A1O75387 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms