Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP3O75386 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP3O75386 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP3O75386 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP3O75386 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP3O75386 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP3O75386 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TULP3O75386 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TULP3O75386 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP3O75386 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP3O75386 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP3O75386 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP3O75386 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP3O75386 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP3O75386 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP3O75386 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP3O75386 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP3O75386 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP3O75386 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP3O75386 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP3O75386 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP3O75386 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP3O75386 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP3O75386 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP3O75386 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP3O75386 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP3O75386 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP3O75386 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP3O75386 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP3O75386 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP3O75386 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP3O75386 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP3O75386 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP3O75386 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP3O75386 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP3O75386 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP3O75386 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP3O75386 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP3O75386 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP3O75386 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP3O75386 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP3O75386 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP3O75386 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP3O75386 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP3O75386 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP3O75386 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP3O75386 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP3O75386 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP3O75386 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP3O75386 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP3O75386 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP3O75386 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP3O75386 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP3O75386 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP3O75386 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP3O75386 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP3O75386 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP3O75386 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP3O75386 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP3O75386 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP3O75386 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP3O75386 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP3O75386 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP3O75386 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP3O75386 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP3O75386 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP3O75386 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP3O75386 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP3O75386 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP3O75386 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP3O75386 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP3O75386 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP3O75386 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP3O75386 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP3O75386 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP3O75386 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP3O75386 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP3O75386 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP3O75386 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP3O75386 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP3O75386 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP3O75386 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP3O75386 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP3O75386 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP3O75386 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP3O75386 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP3O75386 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP3O75386 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP3O75386 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP3O75386 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP3O75386 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP3O75386 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP3O75386 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP3O75386 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP3O75386 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TULP3O75386 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP3O75386 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP3O75386 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP3O75386 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP3O75386 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms