Protein–RNA interactions for Protein: O75367

H2AFY, Core histone macro-H2A.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFYO75367 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFYO75367 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFYO75367 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
H2AFYO75367 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2AFYO75367 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFYO75367 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFYO75367 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFYO75367 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFYO75367 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFYO75367 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFYO75367 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFYO75367 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2AFYO75367 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms