Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPFIA3O75145 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPFIA3O75145 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPFIA3O75145 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPFIA3O75145 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIA3O75145 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms