Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM20BO75063 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20BO75063 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20BO75063 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20BO75063 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM20BO75063 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms