Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IGSF3O75054 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IGSF3O75054 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IGSF3O75054 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
IGSF3O75054 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
IGSF3O75054 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IGSF3O75054 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
IGSF3O75054 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IGSF3O75054 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
IGSF3O75054 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
IGSF3O75054 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
IGSF3O75054 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
IGSF3O75054 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IGSF3O75054 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
IGSF3O75054 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IGSF3O75054 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms