Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD2O60548 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXD2O60548 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD2O60548 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD2O60548 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD2O60548 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD2O60548 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD2O60548 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD2O60548 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD2O60548 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD2O60548 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD2O60548 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD2O60548 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD2O60548 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXD2O60548 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD2O60548 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD2O60548 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms