Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
KIAA0556O60303 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
KIAA0556O60303 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
KIAA0556O60303 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
KIAA0556O60303 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
KIAA0556O60303 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
KIAA0556O60303 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
KIAA0556O60303 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
KIAA0556O60303 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
KIAA0556O60303 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
KIAA0556O60303 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
KIAA0556O60303 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
KIAA0556O60303 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
KIAA0556O60303 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
KIAA0556O60303 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
KIAA0556O60303 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
KIAA0556O60303 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
KIAA0556O60303 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
KIAA0556O60303 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
KIAA0556O60303 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
KIAA0556O60303 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
KIAA0556O60303 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
KIAA0556O60303 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
KIAA0556O60303 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
KIAA0556O60303 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
KIAA0556O60303 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
KIAA0556O60303 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
KIAA0556O60303 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
KIAA0556O60303 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
KIAA0556O60303 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
KIAA0556O60303 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
KIAA0556O60303 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.19
KIAA0556O60303 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.19
KIAA0556O60303 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
KIAA0556O60303 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
KIAA0556O60303 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
KIAA0556O60303 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
KIAA0556O60303 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
KIAA0556O60303 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
KIAA0556O60303 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
KIAA0556O60303 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
KIAA0556O60303 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
KIAA0556O60303 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
KIAA0556O60303 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms