Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX1O43933 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX1O43933 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX1O43933 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX1O43933 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX1O43933 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX1O43933 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX1O43933 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX1O43933 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX1O43933 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX1O43933 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX1O43933 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX1O43933 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX1O43933 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX1O43933 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX1O43933 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX1O43933 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX1O43933 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX1O43933 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX1O43933 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX1O43933 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX1O43933 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX1O43933 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX1O43933 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX1O43933 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX1O43933 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX1O43933 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX1O43933 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX1O43933 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX1O43933 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX1O43933 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX1O43933 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX1O43933 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX1O43933 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX1O43933 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX1O43933 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX1O43933 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX1O43933 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX1O43933 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX1O43933 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX1O43933 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX1O43933 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX1O43933 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX1O43933 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX1O43933 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX1O43933 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX1O43933 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX1O43933 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX1O43933 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX1O43933 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX1O43933 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX1O43933 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX1O43933 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX1O43933 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX1O43933 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX1O43933 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX1O43933 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX1O43933 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX1O43933 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX1O43933 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX1O43933 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX1O43933 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX1O43933 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX1O43933 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX1O43933 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX1O43933 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX1O43933 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX1O43933 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX1O43933 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX1O43933 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX1O43933 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX1O43933 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX1O43933 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX1O43933 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX1O43933 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX1O43933 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX1O43933 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX1O43933 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX1O43933 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX1O43933 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX1O43933 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX1O43933 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX1O43933 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX1O43933 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX1O43933 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX1O43933 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX1O43933 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX1O43933 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX1O43933 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX1O43933 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX1O43933 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX1O43933 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX1O43933 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX1O43933 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX1O43933 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX1O43933 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX1O43933 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX1O43933 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX1O43933 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX1O43933 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms