Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTN4O43707 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACTN4O43707 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACTN4O43707 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACTN4O43707 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms