Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHGDHO43175 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHGDHO43175 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PHGDHO43175 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHGDHO43175 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHGDHO43175 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms