Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHUKO15111 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHUKO15111 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHUKO15111 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHUKO15111 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHUKO15111 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHUKO15111 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHUKO15111 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHUKO15111 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHUKO15111 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHUKO15111 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHUKO15111 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHUKO15111 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHUKO15111 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHUKO15111 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHUKO15111 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHUKO15111 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHUKO15111 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHUKO15111 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHUKO15111 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHUKO15111 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHUKO15111 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHUKO15111 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHUKO15111 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHUKO15111 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHUKO15111 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHUKO15111 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHUKO15111 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHUKO15111 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHUKO15111 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHUKO15111 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHUKO15111 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHUKO15111 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHUKO15111 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHUKO15111 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHUKO15111 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHUKO15111 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHUKO15111 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHUKO15111 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHUKO15111 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHUKO15111 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHUKO15111 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHUKO15111 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHUKO15111 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHUKO15111 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHUKO15111 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHUKO15111 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHUKO15111 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHUKO15111 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHUKO15111 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHUKO15111 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHUKO15111 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHUKO15111 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHUKO15111 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHUKO15111 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHUKO15111 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHUKO15111 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHUKO15111 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHUKO15111 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHUKO15111 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHUKO15111 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHUKO15111 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHUKO15111 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHUKO15111 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHUKO15111 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHUKO15111 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHUKO15111 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHUKO15111 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHUKO15111 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHUKO15111 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHUKO15111 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHUKO15111 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHUKO15111 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHUKO15111 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHUKO15111 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHUKO15111 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHUKO15111 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHUKO15111 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHUKO15111 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHUKO15111 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHUKO15111 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHUKO15111 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHUKO15111 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHUKO15111 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHUKO15111 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHUKO15111 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHUKO15111 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHUKO15111 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHUKO15111 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHUKO15111 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHUKO15111 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHUKO15111 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHUKO15111 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHUKO15111 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHUKO15111 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHUKO15111 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHUKO15111 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHUKO15111 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHUKO15111 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHUKO15111 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms