Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PODXLO00592 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PODXLO00592 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PODXLO00592 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PODXLO00592 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PODXLO00592 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PODXLO00592 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PODXLO00592 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PODXLO00592 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PODXLO00592 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXLO00592 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PODXLO00592 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PODXLO00592 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PODXLO00592 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PODXLO00592 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PODXLO00592 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PODXLO00592 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PODXLO00592 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PODXLO00592 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PODXLO00592 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PODXLO00592 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PODXLO00592 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PODXLO00592 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PODXLO00592 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PODXLO00592 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PODXLO00592 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PODXLO00592 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PODXLO00592 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PODXLO00592 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PODXLO00592 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PODXLO00592 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PODXLO00592 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PODXLO00592 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PODXLO00592 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PODXLO00592 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PODXLO00592 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PODXLO00592 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXLO00592 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PODXLO00592 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXLO00592 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXLO00592 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PODXLO00592 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PODXLO00592 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PODXLO00592 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PODXLO00592 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PODXLO00592 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PODXLO00592 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PODXLO00592 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PODXLO00592 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PODXLO00592 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PODXLO00592 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PODXLO00592 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PODXLO00592 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PODXLO00592 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PODXLO00592 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PODXLO00592 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PODXLO00592 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PODXLO00592 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXLO00592 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXLO00592 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXLO00592 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXLO00592 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PODXLO00592 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PODXLO00592 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PODXLO00592 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PODXLO00592 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PODXLO00592 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PODXLO00592 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PODXLO00592 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PODXLO00592 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PODXLO00592 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PODXLO00592 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PODXLO00592 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXLO00592 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXLO00592 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXLO00592 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PODXLO00592 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PODXLO00592 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXLO00592 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXLO00592 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXLO00592 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXLO00592 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PODXLO00592 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PODXLO00592 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PODXLO00592 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PODXLO00592 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PODXLO00592 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PODXLO00592 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PODXLO00592 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PODXLO00592 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PODXLO00592 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PODXLO00592 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXLO00592 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXLO00592 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PODXLO00592 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXLO00592 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXLO00592 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXLO00592 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PODXLO00592 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXLO00592 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms