Protein–RNA interactions for Protein: O00305

CACNB4, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB4O00305 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNB4O00305 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNB4O00305 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNB4O00305 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB4O00305 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNB4O00305 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB4O00305 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB4O00305 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB4O00305 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB4O00305 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms