Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BNH8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNH8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNH8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNH8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNH8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNH8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNH8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNH8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNH8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNH8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNH8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNH8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3BNH8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNH8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNH8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNH8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNH8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNH8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNH8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNH8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNH8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNH8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNH8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNH8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNH8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNH8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNH8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNH8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNH8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNH8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNH8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNH8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNH8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNH8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNH8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNH8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNH8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNH8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNH8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNH8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H3BNH8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H3BNH8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H3BNH8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNH8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNH8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNH8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNH8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNH8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNH8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNH8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNH8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNH8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNH8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNH8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNH8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNH8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNH8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNH8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNH8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNH8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNH8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNH8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNH8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNH8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNH8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNH8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNH8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNH8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BNH8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BNH8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BNH8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BNH8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BNH8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BNH8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BNH8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BNH8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BNH8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BNH8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BNH8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BNH8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BNH8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BNH8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BNH8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BNH8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BNH8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BNH8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BNH8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BNH8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BNH8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BNH8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BNH8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNH8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNH8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNH8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNH8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNH8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNH8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNH8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNH8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms