Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf98E9PRG8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf98E9PRG8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf98E9PRG8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf98E9PRG8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms