Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PQ18 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PQ18 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PQ18 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PQ18 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PQ18 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PQ18 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PQ18 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PQ18 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PQ18 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PQ18 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PQ18 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PQ18 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PQ18 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PQ18 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PQ18 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PQ18 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PQ18 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PQ18 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PQ18 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PQ18 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PQ18 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PQ18 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PQ18 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PQ18 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PQ18 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PQ18 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PQ18 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PQ18 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PQ18 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PQ18 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PQ18 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PQ18 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PQ18 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PQ18 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PQ18 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PQ18 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PQ18 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PQ18 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PQ18 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
E9PQ18 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
E9PQ18 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PQ18 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PQ18 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PQ18 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PQ18 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PQ18 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PQ18 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PQ18 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PQ18 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PQ18 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PQ18 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PQ18 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PQ18 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PQ18 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PQ18 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PQ18 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PQ18 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PQ18 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PQ18 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PQ18 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PQ18 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PQ18 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PQ18 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PQ18 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PQ18 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PQ18 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PQ18 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PQ18 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PQ18 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PQ18 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PQ18 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PQ18 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PQ18 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PQ18 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PQ18 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PQ18 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PQ18 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PQ18 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PQ18 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PQ18 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PQ18 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PQ18 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PQ18 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PQ18 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PQ18 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PQ18 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PQ18 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PQ18 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PQ18 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PQ18 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PQ18 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PQ18 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PQ18 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PQ18 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PQ18 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PQ18 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PQ18 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PQ18 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PQ18 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms