Protein–RNA interactions for Protein: A8MXK1

VSTM5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM5A8MXK1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM5A8MXK1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VSTM5A8MXK1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VSTM5A8MXK1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM5A8MXK1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM5A8MXK1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM5A8MXK1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM5A8MXK1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM5A8MXK1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM5A8MXK1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM5A8MXK1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM5A8MXK1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM5A8MXK1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSTM5A8MXK1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms