Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD3L3A6NE82 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3L3A6NE82 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3L3A6NE82 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD3L3A6NE82 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms