Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 GRB10-209ENST00000406641 2700 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068448.1-201ENST00000623902 3925 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K13-203ENST00000424227 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025678.3-201ENST00000623619 4824 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MOBP-202ENST00000383754 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ABI1-204ENST00000376138 3503 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ABI1-208ENST00000376160 3515 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF577-214ENST00000639636 3148 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3HC1-203ENST00000360708 1676 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PAMR1-206ENST00000615849 2801 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TTI2-202ENST00000431156 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC17-202ENST00000299240 3648 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC49-203ENST00000443425 3085 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP1GAP2-202ENST00000366401 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf57-201ENST00000280352 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC14-201ENST00000296015 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms