Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL11Q9NVR0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL11Q9NVR0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms