Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPCDR1Q9BY65 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms