Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms