Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL22Q53GT1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms