Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.187e-14■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PEAK1-208ENST00000567337 555 ntTSL 415.96■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 EMC9-207ENST00000560600 771 ntTSL 515.71■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 EMC9-204ENST00000558200 769 ntTSL 215.66■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-228ENST00000566975 580 ntTSL 415.55■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-208ENST00000561524 577 ntTSL 415.55■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.077e-14■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-210ENST00000562503 737 ntTSL 415.39■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ASF1B-204ENST00000590835 746 ntTSL 515.28■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DNM1-204ENST00000441149 3286 ntTSL 1 (best)15.21■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.017e-14■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.017e-14■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 COL18A1-205ENST00000423214 839 ntTSL 514.82□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRELID3A-206ENST00000589565 777 ntTSL 314.8□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRELID3A-207ENST00000589952 488 ntTSL 414.75□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRELID3A-205ENST00000588729 529 ntTSL 414.68□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRELID3A-204ENST00000587862 580 ntTSL 514.67□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNPO2-205ENST00000586775 945 ntTSL 314.67□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SMARCD1-211ENST00000551497 536 ntTSL 414.47□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-226ENST00000566648 651 ntTSL 314.46□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNPO2-208ENST00000587654 575 ntTSL 414.4□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.137e-14■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 E2F4-205ENST00000565226 446 ntTSL 514.2□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CACNB1-206ENST00000539338 5308 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-232ENST00000569112 564 ntTSL 414.06□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRKD2-210ENST00000597641 456 ntTSL 413.81□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-230ENST00000567204 516 ntTSL 413.75□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MYO19-204ENST00000610992 5743 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRKD2-205ENST00000595132 624 ntTSL 513.25□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-212ENST00000562984 551 ntTSL 413.2□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-216ENST00000564136 3071 ntTSL 213.18□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CRYBB2P1-201ENST00000354451 1560 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-233ENST00000569222 443 ntTSL 312.76□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TXNDC11-208ENST00000575591 615 ntTSL 312.75□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRKD2-215ENST00000601605 536 ntTSL 512.58□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 212.55□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAPKAP1-216ENST00000473837 1032 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 FAM213A-201ENST00000372181 2058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MYO19-219ENST00000620413 465 ntTSL 212.34□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CDC45-208ENST00000471470 857 ntTSL 512.27□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SPIN1-201ENST00000375859 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ASTN2-203ENST00000341734 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-220ENST00000565351 297 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 FUT10-205ENST00000518076 1221 ntTSL 411.92□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MYO19-213ENST00000614623 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DNM1-227ENST00000637999 1429 ntTSL 511.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAPKAP1-214ENST00000448439 722 ntTSL 511.45□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRKD2-211ENST00000598633 541 ntTSL 511.12□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNPO2-214ENST00000589337 541 ntTSL 411.03□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-234ENST00000569619 698 ntTSL 310.91□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAPKAP1-215ENST00000468896 401 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-222ENST00000565481 788 ntTSL 510.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MYO19-226ENST00000621550 4299 ntTSL 510.72□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TXNDC11-204ENST00000571882 581 ntTSL 510.31□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CACNB1-207ENST00000577582 563 ntTSL 410.2□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TRAF2-205ENST00000466107 233 ntTSL 310.1□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ADD1-216ENST00000511797 671 ntTSL 59.59□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 30.9
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 360.8 ms