Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPINO95295 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms