Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STX6O43752 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX6O43752 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX6O43752 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX6O43752 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX6O43752 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX6O43752 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX6O43752 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX6O43752 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX6O43752 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX6O43752 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STX6O43752 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms