Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRDCB7Z8K6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms