Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DEV8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DEV8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DEV8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DEV8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DEV8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DEV8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DEV8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DEV8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DEV8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DEV8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DEV8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DEV8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B4DEV8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms