Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms