Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC25A47Q6Q0C1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms