Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 DARS-204ENST00000441323 651 ntTSL 37.4□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.76□□□□□ -1.334e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DARS-205ENST00000449218 543 ntTSL 36.48□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.424e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DARS-207ENST00000463008 412 ntTSL 54.77□□□□□ -1.654e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.855e-8■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TTC3-216ENST00000479930 8998 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -15e-8■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.415e-8■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.665e-8■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.457e-9■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.447e-9■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.473e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.144e-12■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNFRSF10B-207ENST00000523504 1464 ntTSL 220.85■□□□□ 0.934e-12■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNFRSF10B-206ENST00000520109 674 ntTSL 217.8■□□□□ 0.444e-12■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNFRSF10B-201ENST00000276431 4146 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.634e-12■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNFRSF10B-208ENST00000523752 3328 ntTSL 1 (best)7.85□□□□□ -1.154e-12■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-207ENST00000635938 593 ntTSL 216.67■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-212ENST00000637087 532 ntTSL 316.67■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-214ENST00000637783 578 ntTSL 416.18■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-210ENST00000636659 633 ntTSL 515.19■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-206ENST00000508246 2313 ntTSL 215.12■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-215ENST00000637951 575 ntTSL 214.41□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-202ENST00000478241 2924 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-211ENST00000636790 572 ntTSL 410.94□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-213ENST00000637092 552 ntTSL 510.7□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TMEM198B-209ENST00000636428 884 ntTSL 29.85□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.38■■■□□ 2.132e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.792e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)24.44■■□□□ 1.52e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 E4F1-202ENST00000562589 817 ntTSL 523.73■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TXNDC11-206ENST00000573174 919 ntTSL 323.66■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ADD1-215ENST00000510101 704 ntTSL 323.55■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.352e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-209ENST00000562311 777 ntTSL 523.34■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRKD2-207ENST00000597088 855 ntTSL 223.04■■□□□ 1.282e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SMARCD1-203ENST00000547247 1584 ntTSL 1 (best)22.28■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAFK-202ENST00000403150 2773 ntTSL 221.83■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 AMFR-211ENST00000568657 539 ntTSL 421.24■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SMARCD1-209ENST00000550477 911 ntTSL 321.16■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SMARCD1-204ENST00000547637 587 ntTSL 221.16■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-223ENST00000565684 623 ntTSL 521.12■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 COL18A1-207ENST00000473212 2515 ntTSL 220.7■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ADD1-213ENST00000508684 3059 ntTSL 220.54■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SMARCD1-212ENST00000551966 881 ntTSL 519.8■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAPKAP1-210ENST00000427078 816 ntTSL 519.78■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SPIN1-202ENST00000462844 599 ntTSL 219.75■□□□□ 0.757e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PEAK1-206ENST00000564328 2323 ntTSL 519.66■□□□□ 0.744e-6■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 GAK-219ENST00000512325 577 ntTSL 319.62■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SPIN1-203ENST00000469017 2082 ntTSL 219.54■□□□□ 0.727e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PHF23-210ENST00000574407 497 ntTSL 219.45■□□□□ 0.77e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PEAK1-209ENST00000567808 520 ntTSL 319.28■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 FIZ1-204ENST00000590714 4686 ntTSL 1 (best)19.17■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ASF1B-203ENST00000589468 587 ntTSL 318.85■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PEAK1-210ENST00000569159 531 ntTSL 418.44■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 418.41■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 E4F1-207ENST00000565413 940 ntTSL 318.18■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 E2F4-209ENST00000567228 757 ntTSL 217.94■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SPIN1-206ENST00000485804 814 ntTSL 317.38■□□□□ 0.377e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 PI4KAP1-203ENST00000612500 1869 ntTSL 217.14■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 EPHA2-204ENST00000480202 795 ntTSL 516.93■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 TNPO2-216ENST00000589956 594 ntTSL 516.76■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.277e-14■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 SPIN1-205ENST00000485565 706 ntTSL 316.67■□□□□ 0.267e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 C5orf66-201ENST00000505828 561 ntTSL 416.67■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 E4F1-209ENST00000569796 5931 ntTSL 216.59■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 30.9
PCBP2Q15366 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 30.9
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