Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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