Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 AC010132.3-202ENST00000433579 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.49■■□□□ 1.352e-6■■■■□ 21.7
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TARDBPQ13148 DNMT1-216ENST00000588952 841 ntTSL 519.17■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.642e-12■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 ATG4B-217ENST00000475693 2237 ntTSL 216.9■□□□□ 0.32e-12■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 ATG4B-201ENST00000344376 1566 ntTSL 516.06■□□□□ 0.162e-12■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 EHMT1-223ENST00000629808 689 ntTSL 516.05■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 ATG4B-225ENST00000494465 2365 ntTSL 515.36■□□□□ 0.052e-12■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 ATG4B-213ENST00000460211 871 ntTSL 214.8□□□□□ -0.042e-12■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-12■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.132e-12■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.162e-12■■■■□ 21.7
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TARDBPQ13148 ATG4B-210ENST00000428861 580 ntTSL 210.67□□□□□ -0.72e-12■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 PSMA2-203ENST00000436986 1453 ntTSL 38.33□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 PSMA2-202ENST00000411875 4251 ntTSL 1 (best)6.99□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.672e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 PVT1-208ENST00000519481 542 ntTSL 211.1□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 PVT1-209ENST00000520913 584 ntTSL 210.83□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 PVT1-206ENST00000517838 518 ntTSL 27.56□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 MCU-206ENST00000603649 473 ntTSL 511.06□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 01e-7■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)14.89□□□□□ -0.031e-7■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 MCU-208ENST00000604372 894 ntTSL 1 (best)27.1■■□□□ 1.932e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 MCU-209ENST00000604679 1074 ntTSL 513.68□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 MCU-211ENST00000605597 3224 ntTSL 212.22□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 21.7
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TARDBPQ13148 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.79e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 ZNF740-204ENST00000552593 966 ntTSL 325.24■■□□□ 1.632e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 SMIM15-201ENST00000339020 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 21.6
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TARDBPQ13148 USP36-217ENST00000590312 549 ntTSL 34□□□□□ -1.773e-6■■■■□ 21.6
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TARDBPQ13148 PPP2R2A-211ENST00000520329 836 ntTSL 514.45□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 21.6
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TARDBPQ13148 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 21.6
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TARDBPQ13148 PPP2R2A-213ENST00000521095 579 ntTSL 35.27□□□□□ -1.572e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.582e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 PPP2R2A-221ENST00000523964 567 ntTSL 45.03□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 21.6
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TARDBPQ13148 PPP2R2A-217ENST00000522482 576 ntTSL 43.62□□□□□ -1.832e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 PPP2R2A-210ENST00000519636 575 ntTSL 53.3□□□□□ -1.882e-6■■■■□ 21.6
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TARDBPQ13148 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-20■■■■□ 21.6
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TARDBPQ13148 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 516.66■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 21.6
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TARDBPQ13148 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-204ENST00000525699 516 ntTSL 525.85■■□□□ 1.733e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-214ENST00000533998 581 ntTSL 325.29■■□□□ 1.643e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-212ENST00000533383 982 ntTSL 523.14■■□□□ 1.293e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-202ENST00000524546 750 ntTSL 323.14■■□□□ 1.293e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.093e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-206ENST00000527153 582 ntTSL 320.82■□□□□ 0.923e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-205ENST00000526755 4676 ntTSL 1 (best)14.69□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.213e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.313e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 CALN1-206ENST00000446128 550 ntTSL 411.81□□□□□ -0.523e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-209ENST00000531266 590 ntTSL 511.13□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-211ENST00000533368 534 ntTSL 210.81□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-213ENST00000533559 429 ntTSL 37.31□□□□□ -1.243e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FNTA-210ENST00000533336 874 ntTSL 36.66□□□□□ -1.343e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.523e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.196e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FAM13A-210ENST00000507352 1306 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.75e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FAM13A-220ENST00000513837 2590 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.895e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FAM13A-212ENST00000508369 3169 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.975e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FAM13A-207ENST00000504836 2287 ntTSL 29.01□□□□□ -0.975e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.15e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.125e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.135e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.215e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 MBOAT2-207ENST00000477073 754 ntTSL 321.07■□□□□ 0.961e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 MBOAT2-203ENST00000462696 580 ntTSL 416.22■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 21.6
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