Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms