Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A8MVJ9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A8MVJ9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A8MVJ9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A8MVJ9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms