Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL559P-201ENST00000476501 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A10-202ENST00000486000 497 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GUSBP2-203ENST00000492832 801 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244505.1-201ENST00000502642 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105206.2-201ENST00000523556 515 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC013489.2-201ENST00000558732 276 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HPR-203ENST00000561690 634 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RHOXF1P3-201ENST00000635058 502 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NF1P1-201ENST00000604105 2645 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PITRM1-AS1-201ENST00000430356 3998 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355602.1-201ENST00000641472 3402 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00910-202ENST00000586231 2890 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM59-201ENST00000234831 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMD4B-214ENST00000611159 3662 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00923-201ENST00000503768 2036 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 URGCP-202ENST00000402306 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM131B-201ENST00000409222 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356019.2-201ENST00000556738 3829 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PKP1-202ENST00000352845 2244 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK3-220ENST00000626019 2741 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA2-201ENST00000421699 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms