RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430356.3

PITRM1-AS1-201, PITRM1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PITRM1-AS1, Length 3,998 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NISCHQ9Y2I1 1504 aa16.92■□□□□ 0.3
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.59□□□□□ -0.07
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.38□□□□□ -0.11
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABCC9O60706 1549 aa14.16□□□□□ -0.14
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.14□□□□□ -0.15
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.07□□□□□ -0.16
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 HRCP23327 699 aa14.06□□□□□ -0.16
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.02□□□□□ -0.17
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.97□□□□□ -0.17
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SCRIBQ14160 1630 aa13.68□□□□□ -0.22
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.67□□□□□ -0.22
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NACADO15069 1562 aa13.67□□□□□ -0.22
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa13.59□□□□□ -0.23
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.47□□□□□ -0.25
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 UNC13AQ9UPW8 1703 aa13.34□□□□□ -0.27
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CECR2Q9BXF3 1484 aa13.29□□□□□ -0.28
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.23□□□□□ -0.29
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.2□□□□□ -0.3
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.15□□□□□ -0.3
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MYT1Q01538 1121 aa13.1□□□□□ -0.31
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 WIZO95785 1651 aa13.04□□□□□ -0.32
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRIM41Q8WV44 630 aa13.02□□□□□ -0.32
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13□□□□□ -0.33
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SMARCA4P51532 1647 aa13□□□□□ -0.33
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NEUROD1Q13562 356 aa12.99□□□□□ -0.33
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa12.83□□□□□ -0.36
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.77□□□□□ -0.37
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SMARCA2P51531 1590 aa12.74□□□□□ -0.37
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PEG3Q9GZU2 1588 aa12.73□□□□□ -0.37
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SLC24A1O60721 1099 aa12.71□□□□□ -0.37
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa12.69□□□□□ -0.38
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NCAPD3P42695 1498 aa12.67□□□□□ -0.38
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIF21BO75037 1637 aa12.66□□□□□ -0.38
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.65□□□□□ -0.38
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 HMGXB3Q12766 1538 aa12.59□□□□□ -0.39
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CUX2O14529 1486 aa12.58□□□□□ -0.4
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABCC8Q09428 1581 aa12.57□□□□□ -0.4
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EEA1Q15075 1411 aa12.54□□□□□ -0.4
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MIER1Q8N108 512 aa12.52□□□□□ -0.41
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.48□□□□□ -0.41
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TNIKQ9UKE5 1360 aa12.46□□□□□ -0.41
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 UBTFP17480 764 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.43□□□□□ -0.42
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NESP48681 1621 aa12.42□□□□□ -0.42
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.41□□□□□ -0.42
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CFTRP13569 1480 aa12.4□□□□□ -0.42
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SYNJ1O43426 1573 aa12.39□□□□□ -0.43
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SOGA1O94964 1423 aa12.34□□□□□ -0.43
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 APLP2Q06481 763 aa12.34□□□□□ -0.43
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PRDM2Q13029 1718 aa12.34□□□□□ -0.43
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.32□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.32□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CEP162Q5TB80 1403 aa12.31□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.29□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MAP3K1Q13233 1512 aa12.28□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.28□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CUX1P39880 1505 aa12.27□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BCANQ96GW7 911 aa12.26□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GOLGA3Q08378 1498 aa12.24□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TOP2BQ02880 1626 aa12.24□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BCL11AQ9H165 835 aa12.23□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CSRNP3Q8WYN3 585 aa12.23□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.21□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.2□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.19□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.19□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.17□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.16□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.16□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.15□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.14□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms