Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23BQ9NYZ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23BQ9NYZ1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms