Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms