Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms