Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM63Q969Q1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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