Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.539e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ERH-204ENST00000557697 167 ntTSL 5-0.75□□□□□ -2.531e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 SPATA6-206ENST00000465990 293 ntTSL 3-0.78□□□□□ -2.539e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 SMC4-205ENST00000465563 747 ntTSL 2-0.9□□□□□ -2.551e-8■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 SMC4-207ENST00000467263 401 ntTSL 2-2.22□□□□□ -2.761e-8■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.574e-8■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.654e-8■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 SIRPA-201ENST00000356025 3867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.784e-8■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.184e-9■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 EEF1E1-204ENST00000502429 591 ntTSL 37.47□□□□□ -1.214e-9■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.214e-9■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.224e-9■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.816e-7■■■■■ 36.6
PRPF8Q6P2Q9 PPP2R3C-218ENST00000557278 896 ntTSL 1 (best)11.14□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 36.6
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PRPF8Q6P2Q9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 36.6
PRPF8Q6P2Q9 P3H3-207ENST00000544200 957 ntTSL 515.25■□□□□ 0.032e-10■■■■■ 36.6
PRPF8Q6P2Q9 P3H3-211ENST00000612048 2129 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.32e-10■■■■■ 36.6
PRPF8Q6P2Q9 P3H3-202ENST00000536140 3226 ntTSL 210.6□□□□□ -0.712e-10■■■■■ 36.6
PRPF8Q6P2Q9 ERICH1-208ENST00000523053 735 ntTSL 211.41□□□□□ -0.582e-20■■■■■ 36.6
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PRPF8Q6P2Q9 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 36.6
PRPF8Q6P2Q9 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 36.6
PRPF8Q6P2Q9 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 36.6
PRPF8Q6P2Q9 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 36.6
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PRPF8Q6P2Q9 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 36.6
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PRPF8Q6P2Q9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.422e-12■■■■■ 36.6
PRPF8Q6P2Q9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 36.6
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PRPF8Q6P2Q9 PPP3CB-203ENST00000394828 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 36.6
PRPF8Q6P2Q9 PPP3CB-202ENST00000360663 3501 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 36.6
PRPF8Q6P2Q9 MRPL16-203ENST00000531802 557 ntTSL 214.66□□□□□ -0.068e-9■■■■■ 36.6
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PRPF8Q6P2Q9 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.041e-18■■■■■ 36.5
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PRPF8Q6P2Q9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 36.5
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PRPF8Q6P2Q9 TCP1-213ENST00000543517 561 ntTSL 416.67■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 TCP1-208ENST00000537390 691 ntTSL 516.3■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 PMPCA-208ENST00000614402 505 ntTSL 217.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 LUC7L-218ENST00000494366 668 ntTSL 315.63■□□□□ 0.097e-14■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.059e-11■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.049e-11■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 LUC7L-207ENST00000426094 2737 ntTSL 1 (best)14.38□□□□□ -0.119e-11■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.159e-11■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.159e-11■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 LUC7L-206ENST00000419516 1211 ntTSL 511.13□□□□□ -0.639e-11■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 LUC7L-217ENST00000490762 2643 ntTSL 1 (best)10.54□□□□□ -0.729e-11■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 LUC7L-205ENST00000418978 989 ntTSL 510.46□□□□□ -0.739e-11■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 LUC7L-210ENST00000430864 695 ntTSL 59.89□□□□□ -0.839e-11■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 LGALS8-215ENST00000481485 799 ntTSL 56.84□□□□□ -1.312e-17■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 TRIM28-210ENST00000597618 609 ntTSL 29.14□□□□□ -0.952e-11■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 UBE2M-205ENST00000599829 447 ntTSL 36.83□□□□□ -1.327e-9■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 UBE2M-202ENST00000593801 323 ntTSL 36.79□□□□□ -1.327e-9■■■■■ 36.5
PRPF8Q6P2Q9 SMTN-215ENST00000472911 543 ntTSL 210.24□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 36.4
PRPF8Q6P2Q9 EIF4B-214ENST00000553209 380 ntTSL 2-0.49□□□□□ -2.491e-11■■■■■ 36.4
PRPF8Q6P2Q9 DDX11-210ENST00000537136 482 ntTSL 411.26□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 36.4
PRPF8Q6P2Q9 TAF1D-207ENST00000527169 1127 ntTSL 514.49□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 36.4
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