Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPAQ15257 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPAQ15257 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms